Huyện Ninh Phước được thành lập ngày 1 tháng 9 năm 1981 trên cơ sở các xã Phước Sơn, Phước Hà, Nhị Hà, Phước Nam, Phước Hữu, Phước Thái, Phước Dân, Phước Hậu, Phước Thuận của huyện An Sơn và các xã Phước Diêm, Phước Dinh, Phước Hải, An Hải của huyện Ninh Hải cũ. Huyện lỵ đặt tại xã Phước Dân.

Huyện Ninh Phước khi đó gồm có 13 xã: An Hải, Nhị Hà, Phước Dân, Phước Diêm, Phước Dinh, Phước Hà, Phước Hải, Phước Hậu, Phước Hữu, Phước Nam, Phước Sơn, Phước Thái, Phước Thuận.

Ngày 26 tháng 12 năm 1991, tỉnh Ninh Thuận được tái lập từ tỉnh Thuận Hải cũ, huyện Ninh Phước thuộc tỉnh Ninh Thuận.

Ngày 3 tháng 6 năm 1993, chuyển xã Phước Dân thành thị trấn Phước Dân - thị trấn huyện lỵ huyện Ninh Phước.

Ngày 4 tháng 8 năm 1998, thành lập xã Phước Minh trên cơ sở tách đất của các xã Phước Nam và Phước Diêm.

Ngày 22 tháng 11 năm 2002, chia xã Phước Sơn thành 2 xã: Phước Sơn và Phước Vinh.

Tính đến năm 2008, huyện Ninh Phước có thị trấn Phước Dân và 14 xã: An Hải, Nhị Hà, Phước Diêm, Phước Dinh, Phước Hà, Phước Hải, Phước Hậu, Phước Hữu, Phước Minh, Phước Nam, Phước Sơn, Phước Thái, Phước Thuận, Phước Vinh.

Ngày 10 tháng 6 năm 2009:

• Chia xã Phước Nam thành 2 xã: Phước Nam và Phước Ninh
• Chia xã Phước Diêm thành 2 xã: Phước Diêm và Cà Ná
• Cùng thời điểm này, tách 8 xã: Cà Ná, Phước Diêm, Phước Ninh, Phước Nam, Phước Minh, Phước Dinh, Nhị Hà, Phước Hà để thành lập huyện Thuận Nam, huyện Ninh Phước còn lại 1 thị trấn và 8 xã, giữ ổn định cho đến nay.